换热器在长时间换热过程中，会产生污垢，导致换热器被堵塞，当然换热效率也是会降低的，因此也就没有了原有的换热效果了。
长时间的水垢塞，导致换热工况恶化，换热器的传热面超过额定温度或者局部过热，可能引发换热器裂纹爆管，引发事故。所用能耗增加，达不到节能的效果。污垢积聚威胁到换热器的安全运行，并且缩短换热器的使用年限，使得换热器面临设备停机、维修，严重者就需要报废原来的换热器更换新设备使用。
板式换热器在使用过程中。由于水处理设备运行不当。水质控制不达标，将不合格的软化水注入供热系统中，使水中的钙、镁、碳酸盐遇热后分解为碳酸钙和氢氧化镁沉淀物黏结在换热器的受热面上，形成了坚硬的水垢。由于水垢的导热性能差，造成了换热器换热效率的降低以及热能的严重浪费。从而影响了供热的效果，给供热单位造成了严重的负面影响。
换热器未及时清洗，水中的垢质过滤不完全，导致出水口出的水未过滤完全，直接供到用户。一般生活热水机组，基本都是用来洗澡的，未经完全过滤的水长期与皮肤接触，会对人身体产生不好的结果，影响人的身体健康。
防止板式换热器结垢的措施，运行中严把水质关，必须对系统中的水和软化罐中的软化水进行严格的水质化验，合格后才能注人管网中。新的系统投运时，应将换热器与供热系统分开，进行一段时间的循环后，再将换热器并人系统中。以避免管网中杂质进入换热器。在供热系统中，除污器和过滤器应当进行不定期的清理外，还应当保持管网中的清洁，以防止换热器堵塞。